数字PCR(Digital PCR)

发布时间:2026-08-04

1. 技术定义

数字PCR(dPCR)是将样本核酸分子随机分配到大量微小反应单元(如微滴、微孔)中,每个反应单元含0-1个目标核酸分子,通过PCR扩增后,根据 “阳性反应单元(有荧光信号)” 与 “阴性反应单元(无荧光信号)” 的数量,结合泊松分布公式计算目标核酸的绝对拷贝数。相比qRT-PCR,dPCR无需标准曲线,具有更高的灵敏度(可检测低至1拷贝/μL)与准确性,适用于低丰度核酸检测、基因拷贝数变异分析等场景。


2. 技术流程

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3. 核心应用

低丰度基因检测:肿瘤循环游离DNA(cfDNA)中低频突变检测、胎儿游离DNA无创产前诊断;

基因拷贝数变异分析:检测染色体拷贝数变异(CNV)、转基因生物中外源基因拷贝数定量;

微量样本定量:单细胞中特定基因的绝对拷贝数检测、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本中低丰度RNA的定量;

qRT-PCR结果验证:验证qRT-PCR无法准确定量的低丰度基因表达,或作为标准品校准qRT-PCR定量结果。


4. 样本要求

样本类型

最低用量

保存条件

质量要求

注意事项

组织样本

50mg

液氮速冻后-80℃冷冻

DNA/RNA纯度高,无抑制剂

提取后需用试剂盒去除抑制剂

细胞样本

1×106个

加裂解液后-80℃冷冻

核酸无降解,浓度≥0.1ng/μL

裂解液需兼容dPCR反应,避免干扰扩增

血浆/血清样本

100μL

-80℃冷冻
(避免反复冻融)

无溶血,cfDNA浓度≥0.01ng/μL

需用cfDNA专用提取试剂盒,提高回收率

FFPE样本

5张
(
4μm切片)

室温保存
(密封)

DNA片段长度≥50bp,无甲醛残留

用FFPE专用修复试剂盒处理DNA

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