1. 技术定义
空间多组学服务融合空间转录组、空间蛋白组等技术，在保留组织空间位置信息的基础上，解析基因表达和蛋白分布的空间特征，实现 “位置+组学” 的联合分析，解决传统单细胞测序丢失空间信息的问题。依托10× Genomics Visium、Nanostring GeoMx等空间测序平台，提供空间转录组测序（检测组织不同区域的基因表达）、空间蛋白组检测（检测蛋白的空间分布）、空间多组学整合分析（联合转录组与蛋白组数据），可应用于肿瘤空间微环境研究、组织发育空间特征分析、神经科学空间机制研究等方向。
2. 核心应用
肿瘤研究领域：肿瘤空间异质性分析、肿瘤-免疫细胞空间互作研究、肿瘤转移相关的空间基因特征挖掘。
组织发育领域：器官发育过程中的空间基因表达模式、胚胎发育的空间调控机制、组织修复的空间细胞动态变化。
神经科学领域：大脑区域特异性基因表达分析、神经退行性疾病的空间病理机制、神经元连接与基因表达的空间关联。
3.样本要求
空间蛋白组学：
样本类型 | 运输方式 | 注意事项 | 备注 |
新鲜组织 | -80°C保存，干冰运输 | a）用预冷的PBS清洗2-3遍，去除血渍用吸水纸吸干； b）液氮速冻，转移到预冷的离心管； c）标准切片方式； d）组织横截面尽量不超过1.5cm×4.5cm | a）每个样本切3张相邻切片； b）生物学重复建议不低于3个，个体差异较大的个体重复数不少于5个。 |
OCT组织包埋块 |
| a）标注切片方式； b）组织横截面尽量不超过1.5cm×4.5cm； |
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冰冻切片 |
| a）推荐10μm厚度 b）寄送特制载玻片，将切片置于玻片上； c）组织横截面尽量不超过1.5cm×4.5cm； |
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FFPE样本切片 | 常温保存运输 | a）标注切片方式； b）推荐5-10μm厚度，置与玻片上 c）组织横截面尽量不超过1.5cm×4.5cm； |
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空间转录组学：
样本类型 | 取样方法 | 质量要求 | 保存运输 |
新鲜组织 | 新鲜组织取样后立即进行OCT包埋处理，然后液氮速冻，-80℃保存。如无法立即进行包埋处理，则先将组织用干冰速冻后再进行OCT包埋。 | RNA 的 RIN值≥7，组织H&E染色完整、无明显空隙。 | 干冰运输 |
FFPE组织 | 建议将FFPE组织在固定和包埋后存储在4℃，以确保RNA的完整性。 | RNA的DV200 > 30%，组织H&E染色完整、无明显空隙。 | 常温或冰袋运输 |
空间代谢组学：新鲜含水量较低的样本。
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